Darüber hinaus wird diese Fischart im Allgemeinen als Speisefisch geschätzt und ist in der Bevölkerung bekannter als andere Fischarten. Der Lachs kann daher die Funktion einer „Flagship-Species“ erfüllen, um im breiteren gesellschaftlichen Kontext die Akzeptanz für Maßnahmen des aquatischen Biodiversitätsschutzes in all seinen Facetten zu erhöhen. Darüber hinaus ist der Lachs in der EU die wertvollste kommerziell genutzte Fischart. Die genetische Vielfalt des Lachses soll als Teil der gesamten Biodiversität des Rheins gefördert und erhalten werden. Durch eine hohe genetische Vielfalt ist die Wahrscheinlichkeit höher, dass sich Tierarten wie der Lachs an sich verändernde Lebensbedingungen anpassen können.

Der Atlantische Lachs war im Rhein und zahlreichen seiner Zuflüsse eine häufige und wirtschaftlich überaus bedeutende Fischart. Der Rhein galt daher als wichtigster Lachsfluss Europas. Die Bestände waren jedoch bereits im späten 19. Jahrhundert rückläufig und kollabierten in der ersten Hälfte des 20. Jahrhunderts. Die wesentlichen Gründe waren Wanderhindernisse, schlechte Wasserqualität und Überfischung. In den 1950er Jahren galt der Lachs im Rhein als ausgestorben. In den 1980er Jahren wurden ambitionierte Programme zur Sanierung des Rheins und zum Wiederaufbau von Rhein-Lachspopulationen begonnen. Die Gründertiere stammen aus Frankreich (Allier) und Schweden (Ätran).

Dank intensiver Besatzmaßnahmen seit den 90er Jahren ist der Lachs auch im Rhein wieder eine heimische Art geworden und trägt dort als Topprädator (keystone species) zu einer Widerherstellung der natürlichen Fischbiodiversität bei. Der Lachs kann jedoch noch nicht autark im Rhein überleben, er muss weiterhin in Zuchten vermehrt und besetzt werden. Sechs Zuchten beteiligen sich am Zuchtprogramm des Lachses für das deutsche Rheineinzugsgebiet und über eine Millionen Besatzfische werden jährlich in zahlreichen Besatzmaßnahmen in Nordrhein-Westfalen, Hessen, Rheinland-Pfalz und Baden-Württemberg besetzt.

Nach nunmehr ca. 35 Jahren intensiver Bemühungen, den Lachs im Rhein wieder anzusiedeln und zahlreichen anfänglichen Erfolgen und positiven Entwicklungen, zeigen sich in einigen Bereichen jedoch auch Defizite. Das finale Ziel, der Aufbau sich langfristig selbst erhaltender Wildpopulationen des Lachses im Rhein und seinen Nebengewässern wurde bis heute noch nicht erreicht. Weiterhin müssen Lachse in Zuchten vermehrt und die Junglachse anschließend im gesamten Rhein besetzt werden. Die quantitative Erfolgsquote dieser insgesamt sehr kosten- und arbeitsintensiven Besatzmaßnahmen sind bisher wenig bekannt, vermutlich kann hier aber bestenfalls eine weite Spanne der Erfolgsquote unterstellt werden, da aktuelle Zahlen eher abnehmende Anzahlen von Rückkehrern andeuten. Das genaue Vorgehen in der Zucht und beim Besatz unterscheidet sich hinsichtlich der angewendeten Maßnahmen. Beispielweise unterscheiden sich Herkunft und Anzahl der Elterntiere und damit wahrscheinlich die genetische Diversität der Besatztiere. Aber auch das Alter der Besatztiere und der Zeitpunkt des Besatzes variiert bei den Maßnahmen. Der Erfolg der Maßnahmen wird bisher nicht systematisch quantifiziert und einzelne Maßnahmen können daher nicht bewertet und verbessert werden. Es ist dringend nötig, die durchgeführten Maßnahmen zu evaluieren und somit Möglichkeiten zur Verbesserung der Maßnahmen zu schaffen. Dafür soll auch die Koordination zwischen den einzelnen Akteuren verbessert werden. Durch die im Projekt GeMoLaR angestrebte Kooperation für ein gemeinsames und flächendeckendes genetisches Monitoring aller Besatztiere und möglichst vieler zurückkehrender Tiere ergibt sich nun erstmals die Chance einer vollumfänglichen Evaluierung und Optimierung sämtlicher Besatzmaßnahmen im Rheineinzugsgebiet, sowohl im Einzelnen, wie in ihrer Gesamtheit. Nicht zuletzt ist ein derartiges Vorgehen jetzt dringend geboten, da weitere Umweltveränderungen, insbesondere im Abfluss- und Temperaturregime (Dauer von Niedrigwasserphasen, Anteil von Kläranlagenabläufen am Abfluss, Sauerstoffsituation, Trend zur Gewässererwärmung), aktuell in ihrer möglichen Bedeutung für den Lachs im gesamten Rheinsystem unkontrolliert zunehmen dürften.